Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1GO43497 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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