Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP290O15078 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP290O15078 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP290O15078 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP290O15078 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP290O15078 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP290O15078 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP290O15078 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP290O15078 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP290O15078 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP290O15078 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP290O15078 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP290O15078 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP290O15078 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP290O15078 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP290O15078 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP290O15078 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP290O15078 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP290O15078 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP290O15078 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP290O15078 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP290O15078 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP290O15078 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP290O15078 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP290O15078 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP290O15078 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP290O15078 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP290O15078 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP290O15078 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP290O15078 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP290O15078 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP290O15078 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP290O15078 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP290O15078 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP290O15078 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP290O15078 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP290O15078 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP290O15078 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP290O15078 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP290O15078 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP290O15078 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP290O15078 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP290O15078 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP290O15078 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP290O15078 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP290O15078 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP290O15078 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP290O15078 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP290O15078 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP290O15078 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP290O15078 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP290O15078 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP290O15078 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP290O15078 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP290O15078 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP290O15078 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP290O15078 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP290O15078 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP290O15078 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP290O15078 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP290O15078 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP290O15078 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP290O15078 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP290O15078 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP290O15078 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP290O15078 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP290O15078 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP290O15078 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP290O15078 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP290O15078 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP290O15078 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP290O15078 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
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CEP290O15078 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP290O15078 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP290O15078 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP290O15078 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP290O15078 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP290O15078 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP290O15078 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP290O15078 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP290O15078 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP290O15078 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP290O15078 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP290O15078 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP290O15078 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP290O15078 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP290O15078 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP290O15078 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP290O15078 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP290O15078 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP290O15078 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP290O15078 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP290O15078 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP290O15078 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP290O15078 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP290O15078 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP290O15078 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP290O15078 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
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