Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
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