Protein–RNA interactions for Protein: O00233

PSMD9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD9O00233 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD9O00233 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms