Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms