Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF839A8K0R7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms