Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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