Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ARID3CA6NKF2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms