Protein–RNA interactions for Protein: A4D161

FAM221A, Protein FAM221A, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM221AA4D161 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms