Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms