Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD54BQ9Y620 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms