Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAD54L2Q9Y4B4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAD54L2Q9Y4B4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAD54L2Q9Y4B4 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAD54L2Q9Y4B4 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAD54L2Q9Y4B4 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAD54L2Q9Y4B4 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAD54L2Q9Y4B4 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAD54L2Q9Y4B4 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAD54L2Q9Y4B4 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RAD54L2Q9Y4B4 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RAD54L2Q9Y4B4 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAD54L2Q9Y4B4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAD54L2Q9Y4B4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAD54L2Q9Y4B4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAD54L2Q9Y4B4 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RAD54L2Q9Y4B4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAD54L2Q9Y4B4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAD54L2Q9Y4B4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RAD54L2Q9Y4B4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAD54L2Q9Y4B4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAD54L2Q9Y4B4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAD54L2Q9Y4B4 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RAD54L2Q9Y4B4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RAD54L2Q9Y4B4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RAD54L2Q9Y4B4 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RAD54L2Q9Y4B4 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RAD54L2Q9Y4B4 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RAD54L2Q9Y4B4 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAD54L2Q9Y4B4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAD54L2Q9Y4B4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RAD54L2Q9Y4B4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAD54L2Q9Y4B4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAD54L2Q9Y4B4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAD54L2Q9Y4B4 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAD54L2Q9Y4B4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAD54L2Q9Y4B4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAD54L2Q9Y4B4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAD54L2Q9Y4B4 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAD54L2Q9Y4B4 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAD54L2Q9Y4B4 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms