Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM2AQ9Y2K7 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms