Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms