Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHOC2Q9UQ13 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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