Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms