Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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