Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN11AQ9UI33 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms