Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MED13Q9UHV7 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms