Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MLH3Q9UHC1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MLH3Q9UHC1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MLH3Q9UHC1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MLH3Q9UHC1 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms