Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms