Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IGSF9Q9P2J2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGSF9Q9P2J2 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGSF9Q9P2J2 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGSF9Q9P2J2 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGSF9Q9P2J2 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGSF9Q9P2J2 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGSF9Q9P2J2 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGSF9Q9P2J2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGSF9Q9P2J2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGSF9Q9P2J2 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGSF9Q9P2J2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGSF9Q9P2J2 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGSF9Q9P2J2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGSF9Q9P2J2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9Q9P2J2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9Q9P2J2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9Q9P2J2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9Q9P2J2 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9Q9P2J2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9Q9P2J2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9Q9P2J2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9Q9P2J2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9Q9P2J2 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9Q9P2J2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9Q9P2J2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9Q9P2J2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9Q9P2J2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9Q9P2J2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9Q9P2J2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9Q9P2J2 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9Q9P2J2 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9Q9P2J2 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9Q9P2J2 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9Q9P2J2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9Q9P2J2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9Q9P2J2 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9Q9P2J2 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9Q9P2J2 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9Q9P2J2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9Q9P2J2 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9Q9P2J2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9Q9P2J2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9Q9P2J2 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9Q9P2J2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9Q9P2J2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9Q9P2J2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9Q9P2J2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9Q9P2J2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9Q9P2J2 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms