Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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GDE1Q9NZC3 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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GDE1Q9NZC3 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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GDE1Q9NZC3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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