Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms