Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBQLN4Q9NRR5 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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