Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP2

CMC2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC2Q9NRP2 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms