Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI1

BRD7, Bromodomain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD7Q9NPI1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms