Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms