Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms