Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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