Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS8

LRRC2, Leucine-rich repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC2Q9BYS8 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC2Q9BYS8 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms