Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms