Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TDRD1Q9BXT4 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms