Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB2BQ9BVA1 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms