Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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