Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms