Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms