Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NIPSNAP1Q9BPW8 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NIPSNAP1Q9BPW8 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
NIPSNAP1Q9BPW8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
NIPSNAP1Q9BPW8 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NIPSNAP1Q9BPW8 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NIPSNAP1Q9BPW8 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NIPSNAP1Q9BPW8 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP1Q9BPW8 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP1Q9BPW8 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms