Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CICQ96RK0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms