Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms