Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms