Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SENP8Q96LD8 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.2 ms