Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms