Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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FAM3DQ96BQ1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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FAM3DQ96BQ1 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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FAM3DQ96BQ1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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FAM3DQ96BQ1 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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FAM3DQ96BQ1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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FAM3DQ96BQ1 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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FAM3DQ96BQ1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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FAM3DQ96BQ1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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FAM3DQ96BQ1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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FAM3DQ96BQ1 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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FAM3DQ96BQ1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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