Protein–RNA interactions for Protein: Q92616

GCN1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCN1Q92616 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
GCN1Q92616 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCN1Q92616 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCN1Q92616 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GCN1Q92616 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCN1Q92616 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCN1Q92616 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCN1Q92616 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCN1Q92616 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GCN1Q92616 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCN1Q92616 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCN1Q92616 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GCN1Q92616 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCN1Q92616 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCN1Q92616 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCN1Q92616 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GCN1Q92616 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCN1Q92616 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCN1Q92616 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCN1Q92616 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCN1Q92616 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCN1Q92616 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCN1Q92616 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GCN1Q92616 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GCN1Q92616 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCN1Q92616 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GCN1Q92616 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCN1Q92616 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GCN1Q92616 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCN1Q92616 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GCN1Q92616 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCN1Q92616 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCN1Q92616 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCN1Q92616 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCN1Q92616 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCN1Q92616 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCN1Q92616 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCN1Q92616 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCN1Q92616 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCN1Q92616 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCN1Q92616 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCN1Q92616 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCN1Q92616 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms