Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms