Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms