Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC29Q8NA56 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms