Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms