Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms